Podstawą właściwego postępowania leczniczego jest dieta eliminacyjna.
Należy unikać przyjmowania pokarmów, bądź konkretnych składników pokarmowych, które wywołują objawy u naszych pociech – to my jesteśmy odpowiedzialni za właściwe dobieranie posiłków u dzieciaków.
Dopuszcza się również obniżenie w diecie zawartości konkretnego elementu (np. cukru laktozy) – w niektórych przypadkach jest to wystarczające postępowanie, objawy ustępują jedynie przy zmniejszeniu stężenia składnika. U dzieci nietolerujących laktozę można również podawać enzym – laktazę, razem z wypijanym mlekiem. Inne metody leczenia, np. zwalczanie objawów chorobowych, mogą być stosowane jedynie okresowo.