Zapalenia te rozpoznaje się na podstawie wywiadu i badania oczu (ostry stan zapalny z ropną wydzieliną, powodującą sklejanie się brzegów powiek, trwający nie dłużej niż 5–7 dni). Do postawienia rozpoznania nie są konieczne badania bakteriologiczne bezpośrednie, posiewy ani badania cytologiczne. Testy te są wskazane tylko w nawrotowych stanach zapalnych, u chorych niereagujących na leczenie oraz w przypadku wątpliwości diagnostycznych. Należy pamiętać, że wyniki badań bakteriologicznych są zazwyczaj negatywne, jeżeli chory był leczony antybiotykami w kroplach.
Leczenie rozpoczyna się od podania kropli antybiotykowych o szerokim spektrum działania przeciwbakteryjnego (fluorochinolony, aminoglikozydy). Ponieważ bakteryjne zapalenie spojówek jest chorobą, która również sama ulega wyleczeniu, terapia ta ma na celu przede wszystkim skrócenie czasu jej trwania. Należy pamiętać o konieczności utrzymania odpowiedniego dawkowania kropli (np. aminoglikozydy 3 razy dziennie, fluorochinolony 4 razy dziennie), aby zmniejszyć możliwość rozwoju oporności bakterii na stosowanie antybiotyki.
