Do przyczyn środowiskowych zaburzających prawidłowy rozwój płodu i mogących prowadzić do wystąpienia rozszczepu należą:
Niedobór tlenu podczas rozwoju płodowego (Hipoksemia)
Nikotynizm matki
Nadużywanie alkoholu przez matkę w czasie ciąży (Embriopatia alkoholowa)
Promieniowanie jonizujące
Niedobór witamin jak kwas foliowy czy przedawkowanie witaminy A lub E prowadzą do podwyższonego ryzyka dla budowy podniebienia oraz tworzenia się neuronów. Ponieważ ciąża zauważana jest po pewnym okresie (zwykle kilku tygodni), nie udaje się wyeliminować niekorzystnych czynników we wczesnym jej okresie. Przy planowaniu rodziny kobieta nie powinna narażać się na ww. zagrożenia. Istotne jest także trzymanie się zaleceń lekarza ginekologa dotyczących suplementacji kwasu foliowego.
Choroby matki podczas ciąży np. różyczka
Przyjmowanie hydantoiny
Gorączka
Dioksyny
Przyjmowanie kwasu acetylosalicylowego podczas ciąży[potrzebne źródło]
Krwawienia wewnątrzmaciczne
Grypa